Uno de los principales argumentos a favor de lo orgánico es la reducción de la exposición a residuos químicos. Estudios sugieren que los alimentos orgánicos pueden contener niveles significativamente más altos de ciertos antioxidantes (entre un 18% y un 69% más que los convencionales), los cuales ayudan a proteger las células contra el daño. Además, al evitar conservantes artificiales y potenciadores de sabor, se promueve una dieta más "limpia" que se ha vinculado con la reducción de riesgos de obesidad y ciertas enfermedades crónicas.

A pesar de sus ventajas, el sistema orgánico enfrenta críticas, principalmente relacionadas con el . Los productos orgánicos suelen ser más caros debido a los métodos de producción que requieren más mano de obra y a que los rendimientos por hectárea pueden ser menores que en la agricultura industrial. Además, existe un debate sobre si la agricultura exclusivamente orgánica podría alimentar a la población mundial creciente sin expandir masivamente la frontera agrícola a costa de bosques y hábitats naturales. A Comprehensive Analysis of Organic Food - PMC - NIH

: Al eliminar químicos tóxicos, se protege la vida silvestre local, incluyendo insectos polinizadores esenciales como las abejas.